Carmen Scheibenbogen e.a. hebben de expressie van 10 zeer lange niet-coderende RNA's van 44

ME/CVS-patiënten (diagnose: Canadese Consensus Criteria) en 30 gezonde proefpersonen vergeleken.

Niet-coderend RNA is RNA (product eerste stap genexpressie) dat niet 'omgezet' wordt in eiwitten.

Niet-coderend RNA's spelen als regulators, naast met transcriptiefactoren die de genexpressie in

gang zetten of afremmen, een belangrijke rol in de hoeveelheid eiwitten die geproduceerd worden.

10 zeer lange niet-coderende RNA's zijn in verband gebracht met de afweerresponse of bevinden

zich in de buurt van genen die de stressresponse en metabole en neurologische processen reguleren.

De expressie van de drie lange niet-coderende RNA's week significant af: NTT, MIAT en EmX2OS.

Twee van die RNA's hadden een sterk verband met de ernst van de ziekte (NTT en EmX2OS).

Vervolgens bestudeerden de expressie van RNA's in twee specifieke 'cellijnen'

als deze werden blootgesteld aan H2O2 (oxidatieve stress) en poly I:C (dat een virus 'simuleert').

Uit dat experiment bleek dat de expressie van NTT en MIAT 'na stimulatie' duidelijk toenam.

Al met al lijkt het erop dat de afwijkende expressie van NTT, MIAT en EmX2OS mogelijk veroorzaakt wordt door een chronische infectie en oxidatieve stress, (mede) geproduceerd door het afweersysteem.

The expression signature of very long non-coding RNA

in myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome.

J Transl Med. 2018 Aug 17;16(1):231. doi: 10.1186/s12967-018-1600-x.

Yang CA, Bauer S, Ho YC, Sotzny F, Chang JG, Scheibenbogen C.

Abstract

BACKGROUND:

Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome (ME/CFS)

is a chronic debilitating disease with huge social-economic impact.

It has been suggested that

immune dysregulation, nitro-oxidative stress, and metabolic impairment

might contribute to disease pathogenesis.

However, the etiology of ME/CFS remains largely unclear,

and diagnostic/prognostic disease markers are lacking.

Several long noncoding RNAs (lncRNA, > 200 bp)

have been reported to play roles in immunological diseases or in stress responses.

METHODS:

In our study, we examined the expression signature of 10 very long lncRNAs

(> 5 kb, CR933609, His-RNA, AK124742, GNAS1-AS, EmX2OS, MIAT, TUG1, NEAT1, MALAT1, NTT)

in the peripheral blood mononuclear cells of 44 ME/CFS patients.

RESULTS:

LncRNAs NTT, MIAT and EmX2OS levels were found to be significantly elevated in ME/CFS patients

as compared with healthy controls.

Furthermore, NTT and EmX2OS levels increased with disease severity.

Stimulation of human monocytic cell line THP-1 and glioma cell line KALS1

with H2O2 (oxidative stress) and poly (I:C) (double strand RNA, representing viral activation)

increased the expression levels of NTT and MIAT

CONCLUSIONS:

Our study revealed a ME/CFS-associated very long lncRNA expression signature,

which might reflect the regulatory response in ME/CFS patients

to oxidative stress, chronic viral infection and hypoxemia.

Further investigations need to be done

to uncover the functions and potential diagnostic value of these lncRNAs in ME/CFS.

KEYWORDS:

Expression signature; Long non-coding RNA; Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome; Peripheral blood mononuclear cells

PMID: 30119681

PMCID: PMC6098652

DOI: 10.1186/s12967-018-1600-x

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6098652/pdf/12967_2018_Article_1600.pdf