Een algoritme toegepast op afwijkende methylering van én ernst en frequentie van symptomen

in een groep van 70 ME ICC-patiënten levert 4 patiëntensubgroepen (subtypen) op.

Overgemiddelde methylering impliceert een verminderde expressie van het bijbehorende gen.

Subgroep 4 (n=16) is veruit het meest beperkt. De meerderheid (12 patiënten) geeft aan altijd fysiek

uitgeput/ziek te zijn na een kleine inspanning. De afwijkende methylering betreft 4.291 'sites'.

De vijf meest 'afwijkende genen' worden in verband gebracht met

de reparatie van schade aan het DNA (XRCC3),

de eindfase van de aerobe energieproductie (COX10),

specifieke zenuwcellen in de retina (het netvlies) die bijdragen aan

het 'bij elkaar brengen' van visuele informatie (MEGF11),

receptoren ('aanhaakplekken') voor virussen, m.n. poliovirus, mazelen en herpesvirussen (PVRL4) en

een proteïne (eiwit) dat bijdraagt aan de communicatie tussen cellen (TMEM183B/TMEM183A).

Qua ernst van de symptomen, m.n. post-exertional 'malaise', komen groep 1 en 3 op de tweede plaats.

Groep 1 (n=18) kenmerkt zich door afwijkende (verminderde) methylering van DNA op 3,702 'sites',

terwijl bij groep 3 (26 patiënten) slechts 39 afwijkende 'sites' gevonden werden.

Bij dit laatste moet wel worden opgemerkt dat een voorgeslecteerde groep genen onderzocht werd.

Gezien het feit dat 6 van de 10 patiënten in groep 2 aangaven nooit of soms post-exertionele

'malaise' te ervaren is het opmerkelijk dat deze patiënten aan de diagnose ME-ICC voldeden.

De afwijkende methylering in deze laatste groep had betrekking op 58 'sites'.

Integration of DNA methylation & health scores identifies subtypes in myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome.

De Vega WC, Erdman L, Vernon SD, Goldenberg A, McGowan PO.

Epigenomics. 2018 Apr 25. doi: 10.2217/epi-2017-0150.

Abstract

Aim:

To identify subtypes in myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome (ME/CFS)

based on DNA methylation profiles and health scores.

Methods:

DNA methylome profiles in immune cells were integrated with symptomatology

from 70 women with ME/CFS using similarity network fusion to identify subtypes.

Results:

We discovered

four ME/CFS subtypes

associated with

DNA methylation modifications in 1939 CpG sites,

three RAND-36 categories and

five DePaul Symptom Questionnaire measures.

Methylation patterns of

immune response genes and

differences in physical functioning and post-exertional malaise

differentiated the subtypes.

Conclusion:

ME/CFS subtypes

are associated with

specific DNA methylation differences and

health symptomatology and

provide additional evidence of

the potential relevance of

metabolic and immune differences in ME/CFS

with respect to specific symptoms.

Keywords:

CFS, chronic fatigue syndrome, clinical subtyping, complex disease, DNA methylation, epigenetics, health survey, myalgic encephalomyelitis, similarity network fusion, symptom heterogeneity

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29692205