Follow FrankTwisk on Twitter  
   

 

 

 

 

Vernon:

een groot deel van

de afwijkende methylering

van genen betreft

het afweersysteem

 

 

 

 


 

 

 

Suzanne Vernon en collega's onderzochten de methylering van het DNA in lymfocyten

van 12 ME/CVS-patiŽnten waarbij de ziekte begon en die voldeden aan de Canadese criteria

en vergeleken die met de methylering in witte bloedcellen van 12 gezonde proefpersonen.

 

 

 

 

Methylering van een gen, als gevolg van een epigenetisch aanpassingsproces van het DNA,

belemmert de expressie van dat gen en dus de productie van het bijbehorende eiwit.

 

Methylering leidt tot een lange termijn-wijzigingen van de genexpressie ("productieniveaus")

zonder dat het DNA (het gen: het "productievoorschrift") zelf daadwerklijk verandert.

 

Vernon en de anderen vonden afwijkingen in 1192 aanhaakplekken (CpG-eilanden),

corresponderend met 826 genen (weergegeven in tabel 2 die u hier kunt vinden).

 

Een groot deel van de genen waren onder te brengen in de volgende vier "clusters":

  1. aansturing van het afweersysteem (immuuncellen),
  2. metabolisme/stofwisseling (onder andere de aanmaak van energie),
  3. kinases (enzymen die een fosfaatgroep doen aanbrengen op een eiwit of molecuul), en
  4. "cellulaire componenten".

De meeste afwijkingen hadden betrekking op het afweersysteem, hetgeen geen verwondering wekt.

Waar de meeste afwijkingen (ca. 70%) betrekking hadden op toegenomen methylering,

hetgeen (mogelijk) leidt tot een afname van de "eiwitproductie" van de betreffende genen,

lieten de afweersysteem-gerelateerde afwijkingen (relatief) vaker een afgenomen methylering zien,

hetgeen waarschijnlijk leidt tot een verhoogde genexpressie (productie van gerelateerde eiwitten).

 

 


 

Enkele relevante citaten uit het artikel:

 

These data are consistent with previous

observations of a Th1- to Th2-mediated immune response shift

 

...

 

Consistent with these observations, we also observed

changes in DNA methylation within a number of genes

known to regulate the adaptive immune response.

 

...

 

Although the immune system showed most changes in DNA methylation,

we also found an enrichment in gene sets linked to

cellular components, kinase activity, and positive metabolic activity,

supporting previous data indicating differences in the expression of genes

associated with cellular metabolism and oxidative stress in PBMCs from CFS patients.

 

...

 

CFS symptoms are known to worsen causing significant debility after exertion,

concomitant with an increase in inflammatory gene expression.

 

Such data suggest that

latent alterations in immune system function may be 'unmasked' during challenge conditions.

 

 


 

 

DNA Methylation modifications associated with chronic fatigue syndrome.

PLoS ONE 9(8): e104757. doi:10.1371/journal.pone.0104757.

De Vega WC, Vernon SD, McGowan PO.

 

 

 

Abstract

 

 

Chronic Fatigue Syndrome (CFS), also known as myalgic encephalomyelitis,

is a complex multifactorial disease that is characterized by

the persistent presence of fatigue and other particular symptoms for a minimum of 6 months.

 

Symptoms fail to dissipate after sufficient rest and

have major effects on the daily functioning of CFS sufferers.

 

CFS is a multi-system disease with a heterogeneous patient population

showing a wide variety of functional disabilities and

its biological basis remains poorly understood.

 

Stable alterations in gene function in the immune system

have been reported in several studies of CFS.

 

Epigenetic modifications have been implicated in long-term effects on gene function,

however, to our knowledge, genome-wide epigenetic modifications

associated with CFS have not been explored.

 

We examined the DNA methylome in peripheral blood mononuclear cells

isolated from CFS patients and healthy controls

using the Illumina HumanMethylation450 BeadChip array,

controlling for invariant probes and probes overlapping polymorphic sequences.

 

Gene ontology (GO) and network analysis of differentially methylated genes was performed

to determine potential biological pathways showing changes in DNA methylation in CFS.

 

We found an increased abundance of differentially methylated genes

related to the immune response, cellular metabolism, and kinase activity.

 

Genes associated with immune cell regulation,

the largest coordinated enrichment of differentially methylated pathways,

showed hypomethylation within promoters and other gene regulatory elements in CFS.

 

These data are consistent with evidence of multisystem dysregulation in CFS and

implicate the involvement of DNA modifications in CFS pathology.

 

 

http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0104757&representation=PDF