DNA methylatie (methylering) heeft een sterke (epigenetische) invloed op de genexpressie
(de productie van het eiwit waarvan het 'recept' in het DNA opgeslagen ligt):
hypomethylatie (verminderde methylering) houdt verband met een toename van de genexpressie,
hypermethylatie daarentegen impliceert (vaak) een verminderde expressie van ene bepaald gen.
Nancy Klimas, Mary Ann Fletcher,
en anderen hebben de mythelatie van ca. 850.000 CpG-eilanden
van een kleine groep patiënten, die voldeden aan de CVS-criteria en een eigen interpretatie van
de Canadese richtlijnen voor ME/CVS, vergeleken met die van gezonde, inactieve proefpersonen.
Vervolgens hebben zij de DNA-promotors (DNA-gedeelte dat de expressie van het bijbehorende
gen reguleert) met afwijkende methylatie (bijna altijd hypomethylatie) in kaart gebracht.
Al we de functie van de 397 'afwijkende genen' in ogenschouw nemen,
blijkt dat een groot deel van die genen gerelateerd zijn aan
het afweersysteem (cytokines, o.n.
IL-1, IL-10 en IL-17, en
B-cel- en T-cel-activiteit),
de (fysiologische) stressresponse (met name het zogenaamde p38 MAPK-systeem) of
de stofwisseling (het AMPK-systeem dat de energieproductie in response op stress reguleert).
In een studie uit 2015 werd een verminderde AMPK-response op inspanning vastgesteld.
Wellicht dat de toename van de genexpressie het gevolg is van een compensatiemechanisme.
Kortom de studie bevestigt de hoofdrol van het immuunsysteem in de pathofysiologie van 'ME/CVS'.
Kunnen we nu eindelijk verder op zoek naar oplossingen en het CGT/GET-pas achter ons laten.
Identification of Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome-associated
DNA methylation patterns.
PLoS ONE. 2018 Jul 23; 13(7): e0201066.
Trivedi MS, Oltra E, Sarria L, Rose N, Beljanski V, Fletcher MA, Klimas, NG, Nathanson L.
Abstract
Background
Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome (ME/CFS)
is a complex condition involving multiple organ systems and
characterized by persistent/relapsing debilitating fatigue,
immune dysfunction, neurological problems, and
other symptoms not curable for at least 6 months.
Disruption of DNA methylation patterns
has been tied to various immune and neurological diseases;
however, its status in ME/CFS remains uncertain.
Our study aimed at identifying
changes in the DNA methylation patterns that associate with ME/CFS.
Methods
We extracted
genomic DNA from peripheral blood mononuclear cells
from 13 ME/CFS study subjects and 12 healthy controls and
measured global DNA methylation by ELISA-like method and
site-specific methylation status using Illumina MethylationEPIC microarrays.
Pyrosequencing validation included
33 ME/CFS cases and 31 controls from two geographically distant cohorts.
Results
Global DNA methylation levels of ME/CFS cases were similar to those of controls.
However, microarray-based approach allowed
detection of 17,296 differentially methylated CpG sites in 6,368 genes
across regulatory elements and within coding regions of genes.
Analysis of DNA methylation in promoter regions
revealed 307 differentially methylated promoters.
Ingenuity pathway analysis indicated that
genes associated with differentially methylated promoters
participated in at least 15 different pathways
mostly related to cell signaling with a strong immune component.
Conclusions:
This is the first study that has explored
genome-wide epigenetic changes associated with ME/CFS
using the advanced Illumina MethylationEPIC microarrays
covering about 850,000 CpG sites in
two geographically distant cohorts of ME/CFS cases and matched controls.
Our results are aligned with previous studies that indicate
a dysregulation of the immune system in ME/CFS.
They also suggest
a potential role of epigenetic de-regulation in the pathobiology of ME/CFS.
We propose screening of larger cohorts of ME/CFS cases
to determine the external validity of these epigenetic changes
in order to implement them as
possible diagnostic markers in clinical setting.
http://journals.plos.org/plosone/article/file?id=10.1371/journal.pone.0201066&type=printable
|
