Gow, Behan ("een oude rot in het vak") en kollega's hebben de genexpressie
(de mate waarin genen aangesproken worden om specifieke eiwitten aan te maken)
van 8 patienten met postviraal ME/CFS en 7 gezonde mensen bestudeerd.
De konklusie van hun bevindingen kan eigenlijk niemand verbazen...
Gow en kollega's vonden 366 relevante genen met afwijkende expressie:
286 genen zijn "overaktief", 80 genen zijn "onderaktief".
Een belangrijk deel van de afwijkende genenaktiviteit duidt op
- aktivering en ontregeling van het immuunsysteem,
- ontsteking (waarschijnlijk aangestuurd via NF-kB): COX-1/COX-2, NO, IL-6 etc.
- verstoorde intracellulaire afweer/Th1-response: NK-cellen, T-cel-receptoren, etc.
- oxidatieve/nitrosatieve stress
(aanmaak van vrije radikalen, bijv. superoxide en peroxynitriet/ONOO)
- apoptose
(zelfdoding van een cel, bijv. om verspreiding van infekties te voorkomen).
Dit sluit direkt aan bij de bevindingen van Kerr
(klik hier en
hier) en talloze anderen.
De bijbehorende genen zijn in tabel 2 weergegeven:
Table 2. Three altered bio-systems in CFS
Oxidative Stress Genes
Up-regulated
Prostaglandin Synthase: COX-1 and 2,
Haemoglobin gamma A and gamma G
Down-regulated
Glutathion-s-transferase
Apoptosis Genes:
Up-regulated
Annexin -A3, -A5, Serine/threonine kinase 17b, Histones 1&2, Protein S (alpha),
Serum deprivation response (Phosphatidylserine binding protein)
Caspase 1, TGFβ1
Death effector filament forming CED4-like apoptosis protein,
Complement 3a receptor 1, Early growth response 1, TNF-A1P3, -RSF17, -SF4
Immune Dysfunction Genes
(including markers of viral immuno-modulation/evasion)
Up-regulated
DAF (CD55) and CD46
Antigen processing via MHC class II (MHC II DPα1 and DRα)
IL-12, IL-13 and IL-6 biosynthesis
Down-regulated:
The MHC-1 system including:
Natural Killer cell receptors (KIR)
TCR complex (T-cell receptors α, β, δ, γ)
NO production (up-regulation of arginase I & II)
Flavohaemoprotein B5
Leukocyte-derived arginine aminopeptidase (L-rap)
De ziekten die gerelateerd zijn aan de genen met afwijkende produktienivo's zijn:
Top 5 diseases/disorders associated with CFS patients.
Name
|
p-value
|
No of Genes
|
Cancer
|
1.23E-09 - 3.37E-03
|
154
|
Immunological Disease
|
2.72E-19 - 3.09E-03
|
80
|
Connective Tissue Disorders
|
3.50E-18 - 2.06E-03
|
57
|
Inflammatory Disease
|
3.50E-18 – 3.09E-03
|
78
|
Skeletal and Muscular Disorders
|
3.50E-18 - 2.06E-03
|
69
|
Opmerkelijk tenslotte:
Sommige pathogenen, zoals mycoplasma en borellia,
zijn in staat om op verschillende manieren het
afweersysteem "het bos in te sturen".
Het is opmerkelijk dat Gow en kollega's sterke overeenkomsten konstateren
tussen de afwijkende genenaktiviteit bij ME/CVS en die bij borellia - Lyme.
Gow en kollega's geven één geloofwaardige verklaring voor het feit dat
verschillende geneaktiviteit-studies vaak niet dezelfde genen vinden:
de levensduur van mRNA (messenger RNA: het eerste halffabrikaat van de eiwitproduktie)
is slechts een aantal minuten: je moet er dus snel bij zijn om het te zien!
In deze studie zijn een aantal genen gevonden die overeenstemmen met
hetgeen Mikovits en kollega's van het Whitemore-Peterson Institute gevonden hebben:
klik hier.
Jammer genoeg betreft het hier wederom een klein aantal proefpersonenen
(geen verwijt, want dit type onderzoek is kostbaar én de financiële middelen zijn beperkt).
Het zou goed zijn als deze studie op grotere schaal herhaald werd.
Citaten
The overall picture emerging from these results point to a
significant, albeit phenotypically subtle, perturbation of function
in relation to
- microbial defence,
- viral immuno-surveillance and
- cell growth
amongst patients with post-infectious chronic fatigue.
The classical Th1 to Th2 switch
allows intracellular pathogens to evade detection.
Immune evasion
is a well-documented mechanism
by which viruses, bacteria, parasites and cancer cells
avoid destruction by the host.
The immune modulation
in post-Lyme disease fatigue
is remarkably similar to
the gene signature presented here for
patients with CFS.
In addition,
the research data do not prove
if differentially expressed genes
are the predisposing cause or
downstream effect of CFS.
It must be borne in mind, however, that
many mRNAs have very short half-lives
(i.e. less than 2 mins) and therefore
what is observed in the microarray
is a snapshot in time and
may not necessarily
reflect the chronic biological process
inherent of this condition.
A Gene Signature for Post-Infectious Chronic Fatigue Syndrome
BMC Medical Genomics 2009, 2:38. doi:10.1186/1755-8794-2-38
JW Gow, S Hagan, P Herzyk , C Cannon , PO Behan, A Chaudhuri.
Published: 25 June 2009
Abstract (provisional)
Background
At present,
there are
no clinically reliable disease markers for
chronic fatigue syndrome.
DNA chip microarray technology
provides a method for examining
the differential expression of mRNA
from a large number of genes.
The hypothesis was that a gene expression signature,
generated by microarray assays,
could help identify genes
which are dysregulated in patients with CFS and
so provide biomarkers for the condition.
Methods
Human genome-wide Affymetrix GeneChip arrays
(39,000 transcripts derived from 33,000 gene sequences)
were used to compare
the levels of gene expression
in the peripheral blood mononuclear cells of
patients with post-viral chronic fatigue (n=8) and
healthy control subjects (n=7).
Results
Patients and
healthy subjects
differed significantly
in the level of expression of
366 genes.
Analysis of
the differentially expressed genes
indicated functional implications in
immune modulation,
oxidative stress and
apoptosis.
Prototype biomarkers
were identified on the basis of
differential levels of gene expression and
possible biological significance
Conclusions
Differential expression of
key genes
identified in this study
offer an insight into
the possible mechanism of
chronic fatigue following infection.
The representative biomarkers
identified in this research appear
promising as
potential biomarkers
for differential diagnosis and treatment.
Bron:
http://www.biomedcentral.com/1755-8794/2/38
Uitgebreid studierapport:
http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1755-8794-2-38.pdf
Met dank aan Rob
|